Опубликована статья об изменениях транскриптома при ишемической болезни сердца в журнале Molecular and Cellular Cardiology Plus

В журнале Molecular and Cellular Cardiology Plus опубликована статья «RNAseq profiling of blood from patients with coronary artery disease: Signature of a T cell imbalance [Исследование РНК крови пациентов с ишемической болезнью сердца (ИБС): признак нарушения Т-клеток]» с соавторством сотрудников NOVEL.

Статья посвящена изучению нарушения регуляторных T-клеток при ИБС. Используя передовые технологии секвенирования и биоинформатики, исследователи получили точные ответы о функционировании активности генов при ИБС на самой большой выборке.

В частности, показано, что при ИБС задействованы транскрипты, участвующие в иммунном синапсе (взаимодействии). Иммунный синапс представляет собой контактно-зависимый способ связи между Т-клетками и В-клетками, с одной стороны, и различными антигенпрезентирующими и иммуномодулирующими клетками, с другой. Один из наиболее дифференциально экспрессируемых генов, фибромодулин (FMOD, увеличивается в 2.8 раза при ИБС), имеет известную связь с атеросклерозом, кардиомиопатией и железозависимой запрограммированной гибелью клеток.

Также выявлены транскрипты, кодирующие белки, связанные со структурой и функцией иммунного синапса. Nebulette (увеличивается в 2.4 раза при ИБС), участвует в связывании актина и десмина для функционирования цитоскелета и везикулярного движения. В сигнальных путях иммунного синапса присутствовали транскрипты, непосредственно связанные с функцией Т-клеток и контролем дифференцировки. Butyrophilin (увеличивается в 1.7 раза при ИБС) является посредником при активации Т-клеток.

В статье показано, что различные платформы секвенирования (SeqLL и Illumnina) позволяют выявить транскрипты, связанные с изменением T-регуляторных клеток, но с четкими различиями в специфических транскриптах, связанных с ИБС.

С полным текстом статьи можно ознакомиться по ссылке: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S277297612300003X?via%3Dihub