Новые мутации Omicron усиливают иммунный ответ и могут объяснять снижение смертности от COVID-19

В журнале iScience опубликована статья "Mutational pressure promotes release of public CD8+ T cell epitopes by proteasome from SARS-CoV-2 RBD of Omicron and its current lineages" (Мутационное давление способствует высвобождению протеасомой популяционных CD8+ T-клеточных эпитопов из RBD SARS-CoV-2 варианта Омикрон и его текущих линий) с соавторством сотрудника NOVEL.

В работе показано, что мутации в штамме Omicron B.1.1.529 значительно усиливают высвобождение двух иммунодоминантных эпитопов HLA класса I: 504-GHQPYRVVVL-513 и 496-SFRPTYGVGH-505. Эти эпитопы формируются в результате эффективной обработки – гидролиза рецептор-связывающего домена (RBD) как конститутивными протеасомами (c20S), так и иммунными протеасомами (i20S). Эти протеасомы обеспечивают расщепление белка на антигенные фрагменты, которые затем представляются иммунной системе для активации защитного ответа.

Авторы работы акцентируют внимание на глобальном значении HLA гаплотипов, способных представлять эти эпитопы. Ключевые HLA молекулы, такие как HLA-B07:02, HLA-B08:01, HLA-B51:01, HLA-C01:02, HLA-C06:02 и HLA-C07:02, широко распространены среди населения и охватывают до 82% и 27% мировой популяции для эпитопов 504-GHQPYRVVVL-513 и 496-SFRPTYGVGH-505, соответственно. Этот факт объясняет снижение смертности от COVID-19 в регионах с высокой частотой данных гаплотипов после декабря 2021 года, когда Omicron стал доминирующим персистирующим штаммом.

 С полным текстом статьи можно ознакомиться по ссылке: https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(25)00133-6