Разработаны нейросети для анализа данных single cell RNAseq и аминокислотных последовательностей

C 30 июля по 2 августа 2021 года в Сколковском институте науки и технологий прошла X Международная конференция Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB), в которой участвовали сотрудники ООО "Новые Программные Системы".

Нашу компанию на конференции представляли:

  • к.б.н. Антонец Денис Викторович с докладом на тему «Style transfer with variational autoencoders is a promising approach to RNA-Seq data harmonization and analysis», который был посвящен методу на основе глубокого обучения, позволяющему смоделировать изменение профиля экспрессии генов в ответ на терапию лекарственными препаратами;
  • начальник отдела машинного обучения Русских Николай Евгеньевич с докладом на тему “Functional domain annotation of protein sequences with deep metric learning”. Его выступление было посвящено методу предсказания функциональных доменов в аминокислотных последовательностях посредством анализа маломерных представлений, полученных при помощи методов глубокого обучения. Данный метод направлен на решение так называемой проблемы дальней гомологии и позволяет анализировать широкое многообразие белковых последовательностей, в т. ч. вирусных, не имеющих гомологов с известной функцией.

Представленные в докладах технологии используются для разработки новых методов диагностики и терапии, а также веществ с нужными свойствами.