Опубликованы результаты исследований по ишемической болезни сердца с участием NOVEL

В журнале BMC Medical Genomics была опубликована статья «RNA sequencing of blood in coronary artery disease: involvement of regulatory T cell imbalance [Секвенирование РНК крови при ишемической болезни сердца: участие регуляторного дисбаланса Т-лимфоцитов]»  с соавторством сотрудников Novel Software Systems: к.ф.-м.н., директора Штокало Дмитрия Николаевича и к.б.н. Антонец Дениса Викторовича.

Были исследованы генетически-молекулярные механизмы ишемической болезни сердца на основе данных секвенирования РНК группы из 96 пациентов, поступивших на плановую коронарную катетеризацию. РНК цельной крови была очищена от рибосомной РНК (рРНК) и проанализирована путем одномолекулярного секвенирования РНК (single molecule RNAseq) для выявления транскриптов (TRACs), связанных с ишемической болезнью сердца. Полученные в результате подсчета уровни транскрипции сравнивали между группами для идентификации дифференциально экспрессируемых генов (DEG).

Биоинформатический анализ выявил обогащение транскриптами, такими как FoxP1, ICOSLG, IKZF4 / Eos, SMYD3, TRIM28 и TCF3 / E2A, которые, вероятно, являются маркерами регуляторных Т-клеток (Treg), что согласуется с известным снижением Treg при ИБС.  Когорта валидации из 80 пациентов подтвердила общую картину (снижение регуляции на 92%). TRAC были обогащены транскриптами, связанными со стрессовыми гранулами, которые секвестрируют РНК, а также цилиарными и синаптическими транскриптами, что, возможно, согласуется с изменениями в иммунном синапсе развивающихся Т-клеток.

В результате было обнаружено, что 98% DEG / TRACs были подавлены примерно в 1,7 раза у пациентов с легкой и тяжелой ИБС (стеноз> 20%). TRAC не зависели от сопутствующих факторов риска ИБС, таких как пол, артериальная гипертензия и курение.

Проведенные работы ставят множество новых вопросов перед учеными. Однако совершенно очевидно, что эти исследования идентифицируют новую сигнатуру мРНК Treg-подобного дефекта у пациентов с ИБС и предоставляют план диагностического теста для ИБС. Характер изменений соответствует связанным со стрессом изменениям созревания Т- и Treg-клеток, возможно, из-за изменений в иммунологическом синапсе.

Полный текст статьи Вы можете прочесть по ссылке: https://rdcu.be/cw83g